Эксплуатация очистных сооружений должна производиться квалифицированным инженерно-техническим персоналом.
На больших и средних станциях в составе эксплуатационного персонала должны быть специалисты — химики и биохимики, а при наличии полей орошения — и агроном.
Контроль за качеством поступающей и выходящей сточной воды, за правильным ведением технологического процесса и разработка мероприятий по улучшению технологических процессов производятся лабораториями.